BrainVISA / Anatomist

Nouveau: (16/02/2012) BrainVISA/Anatomist version 4.2.1 est disponible.

Nouveau: (19/01/2011) Soma-workflow version 2.1 est disponible. Voir la page d'accueil de Soma-Workflow.

Nouveau: (05/07/2011) Nouvel atlas de sillons disponible.

BrainVISA est un logiciel qui incarne une usine de traitement d'images. Un panneau de contrôle simple permet à l'utilisateur de lancer des chaînes de traitements sur des séries d'images. Ces traitements sont réalisés via des appels à des commandes lignes fournies par différents laboratoires. Ces commandes lignes sont donc les briques à partir desquelles sont conçues les chaînes d'assemblage de l'usine.

BrainVISA est distribué avec une boîte à outils dédiée à la segmentation d'images IRM pondérées en T1. Le produit de la principale chaîne de traitements issue de cette boîte à outils est le suivant: une classification gris/blanc pour la morphométrie voxel par voxel, des maillages des surfaces de chaque hémiphère pour la visualisation, des maillages sphériques de la matière blanche de chaque hémisphère, un graphe des plissements corticaux, un étiquetage de ces plissements fondé sur une nomenclature des principaux sillons:

Un aperçu du contenu de la distribution est proposé dans les pages d'aide de BrainVISA
A propos de BrainVISA.

Anatomist est un logiciel de visualisation dont la principale originalité réside dans un module générique dédié aux données structurées, c'est-à-dire aux ensembles d'objets reliés entre eux dans une structure de graphe. Ces objets peuvent être les plis corticaux extraits d'une images IRM T1, les faisceaux de fibres extraits d'une image IRM de diffusion, les activations extraites d'une Carte Statistique Paramétrique... Ce module inclue un panneau de contrôle fondé sur une nomenclature, qui peut piloter plusieurs cerveaux simultanément. Anatomist propose également des outils pour projeter facilement les cartes statistiques paramétriques sur des maillages 3D du cerveau, des maillages gonflés de la matière blanche... Enfin, des outils dédiés au dessin manuel permettent diverses applications.

Anatomist est le logiciel de visualisation utilisé par Brainvisa pour montrer la production des lignes d'assemblage. Pour ce faire, Brainvisa télécommande les menus d'Anatomist. C'est pourquoi les requêtes de visualisation les plus simples ne nécessitent aucun apprentissage de l'interface d'Anatomist. Une utilisation plus poussée, en revanche, sera facilitée par la lecture des pages d'aide d'Anatomist.

A propos d'Anatomist