Correction de la Séparation du Cerveau à partir du Masque du Cerveau

Guide pour corriger les erreurs de Ana Split Brain From Brain Mask

Description

Pour une raison ou une autre, la procédure séparant les hémisphères et le cervelet ne vous a pas donné entière satisfaction. En général les problèmes surviennent au niveau de l'interface avec le cervelet. Essayez une des variantes proposées ici. La seule différence entre ces variantes est le seuil initial permettant de définir le masque de la matière blanche sur lequel va être appliquée la procédure d'érosion. Avec un peu de chance, l'une des variantes devrait améliorer les choses.

Dans le cas contraire, il peut s'agir d'un problème lié au comportement de la correction de biais dans le cervelet. Essayez de la reprendre en modifiant certaines options.

Un autre problème peut survenir si une partie du cervelet manque dans l'image. Dans ce cas, modifiez les paramètres de Vip Split Brain, en particulier la taille minimale des composantes connexes prises en compte pour sélectionner les graines.

NB: si vous travaillez sur une espèce de singe, vous devriez tenter d'utiliser la commande ligne sans template.

Si rien ne marche, vous pourrez réaliser certaines corrections en dessinant dans Anatomist: Label volume editor (vous pouvez d'ailleurs utiliser un racourci vers ce traitement sous forme d'icone).

Paramètres

mri_corrected: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )

variant: Choice ( input )

split_mask: Séparation du masque du cerveau ( sortie )

histo_analysis: Analyse d'histogramme ( entrée )

brain_mask: T1 Brain Mask ( entrée )

Use_template: Booléen ( input )

split_template: Hemispheres Template ( optional, entrée )

Commissure_coordinates: Commissure coordinates ( optional, entrée )

Informations techniques

Toolbox : Morphologist

Niveau d'utilisateur : 0

Identifiant : AnaSplitBrainFromBrainMaskCorrection

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components_obsolete/correction/AnaSplitBrainFromBrainMaskCorrection.py

Supported file formats :

mri_corrected :

GIS image, GIS image

split_mask :

GIS image, GIS image

histo_analysis :

Analyse d'histogramme, Analyse d'histogramme

brain_mask :

GIS image, GIS image

split_template :

GIS image, GIS image

Commissure_coordinates :

Commissure coordinates, Commissure coordinates