Extrait de l'histogramme d'une IRM T1 les moyennes et les écarts types des matières grises et blanches
Cette nouvelle analyse de l'histogramme ne peut être utilisée qu'après la nouvelle correction de biais. Elle permet d'éviter certaines faiblesses de la précédente lorsque l'histogramme présente un grand pic de graisse.
t1mri_nobias: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )
use_hfiltered: Booléen ( input )
hfiltered: T1 MRI Filtered For Histo ( optional, entrée )
use_wridges: Booléen ( input )
white_ridges: T1 MRI White Matter Ridges ( optional, entrée )
undersampling: Choice ( input )
histo_analysis: Analyse d'histogramme ( sortie )
histo: Histogramme ( sortie )
fix_random_seed: Booléen ( input )
Toolbox : Morphologist
Niveau d'utilisateur : 0
Identifiant :
NobiasHistoAnalysis
Nom de fichier :
brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components/NobiasHistoAnalysis.py
Supported file formats :
t1mri_nobias :gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 imagehfiltered :gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 imagewhite_ridges :gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 imagehisto_analysis :Analyse d'histogramme, Analyse d'histogrammehisto :Histogramme, Histogramme