Sulcus Parameterization 2015

Définition d'un système de coordonnées sur un sillon.

Description

L'objectif est de paramétrer (définir un système de coordonnées sur) un sillon. Ce sillon peut-être identifié par nom ou label dans un graphe. En sortie on obtient un maillage du sillon, deux textures de coordonnées, et une "grille" de coordonnées. Documentation plus détaillée sur la page du groupe MeCA (si le lien ne marche pas choisissez votre navigateur dans les préférences et redémarrez Brainvisa).

Paramètres

graph: Graphe de sillons corticaux ( entrée )

Graphe à l'intérieur duquel les morceaux du sillon sont identifiés

mri: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )

IRM T1 (corrigée du biais ou non) associée.

label_attributes: Choice ( input )

Le sillon est identifié dans le graphe par son "label" ou son "name".

label_values: String ( input )

valeur du sillon dans le graphe.

orientation: Choice ( input )

Orientation générale du silllon.

sulcus_mesh: Sulcus mesh ( sortie )

Maillage final du sillon

texture_param1: Sulcus y coordinate texture ( sortie )

texture de coordonnée x

coordinates_grid: Sulcus coordinate grid mesh ( sortie )

maillage de la grille de coordonnées.

depth_profile: Sulcus depth profile ( sortie )

The file that contains the depth curve and sulcal profile

dilation: Réel ( input )

Paramètre de dilatation (garder valeur par défaut).

offset: Entier ( input )

Informations techniques

Toolbox : Surface corticale

Niveau d'utilisateur : 0

Identifiant : ParameterizeSulcus2015

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/cortical_surface/processes/anatomy/ParameterizeSulcus2015.py

Supported file formats :

graph :

Graph and data, Graph and data

mri :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

sulcus_mesh :

Maillage MESH, Maillage MESH

texture_param1 :

Texture, Texture

coordinates_grid :

Maillage MESH, Maillage MESH

depth_profile :

Text file, Text file