ClearMap resampling

Module de rééchantillonnage

Paramètres

input: Volume 3D ( entrée )

processes: Entier ( input )

Nombre d'éxécutions lancées en parallèle

processMethod: Choice ( input )

'None' pour exécuter en série, 'parallel' pour éxécuter en parallèle

resolutionSource: ListOf( Réel ) ( input )

Résolution de la source d'entrée : valeurs données pour un zoom de 0.8x sur un microscope LaVisionavec une lentille 2x : 4.0625 4.0625 3.0

resolutionSink: ListOf( Réel ) ( input )

Résolution voulue en sortie

interpolation: Choice ( input )

Méthode d'interpolation choisie : 'linear' pour 'linéaire' ou 'nearestPixel' pour 'plus proche voisin'

orientation: ListOf( Entier ) ( optional, input )

Triplet d'orientation afin d'adapter l'orientation de l'Atas utilisé : 3 entiers relatifs

output: Volume 3D ( sortie )

Informations techniques

Toolbox : Bioprocessing

Niveau d'utilisateur : 3

Identifiant : ClearMapResampling

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/bioprocessing/processes/research/projects/clearmap/ClearMapResampling.py

Supported file formats :

input :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

output :

gz compressed NIFTI-1 image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image