Digital atlas prepare pipeline

None

Paramètres

Input_Volume: Volume 3D ( entrée )

Input_Description_File: CSV file ( entrée )

Lateralized: Booléen ( input )

Output_Hierarchy: Hiérarchie ( sortie )

Output_Volume: Volume 3D ( sortie )

Informations techniques

Toolbox : Bioprocessing

Niveau d'utilisateur : 3

Identifiant : DigitalAtlasPreparePipeline

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/bioprocessing/processes/research/digitalatlas/DigitalAtlasPreparePipeline.py

Supported file formats :

Input_Volume :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

Input_Description_File :

CSV file, CSV file

Output_Hierarchy :

Hiérarchie, Hiérarchie

Output_Volume :

gz compressed NIFTI-1 image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image