Elastix Registration

Réalise le recallage de l'image avec les paramètres d'alignement Elastix

Paramètres

test: Volume 3D ( entrée )

Image à transformer

ElastixTransformationDirectory: Répertoire ( entrée )

Dossier de stockage des paramètre d'alignement Elastix

output: Répertoire ( sortie )

sink: Volume 3D ( sortie )

Nom et destination de l'image recallée

Informations techniques

Toolbox : Bioprocessing

Niveau d'utilisateur : 3

Identifiant : ElastixRegistration

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/bioprocessing/processes/research/projects/clearmap/ElastixRegistration.py

Supported file formats :

test :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

ElastixTransformationDirectory :

Répertoire, Répertoire

output :

Répertoire, Répertoire

sink :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image