1 - Masque du cerveau (SPMt)

Brique très simple qui génère un masque du cerveau à partir d'une carte de type SPMt. Cette étape est essentielle car le masque est nécessaire pour la construction du primal sketch de la carte...

Description

Brique très simple qui génère un masque du cerveau à partir d'une carte de type SPMt. Cette étape est essentielle car le masque est nécessaire pour la construction du primal sketch de la carte... La taille de la dilatation (en mm) doit être de l'ordre de deux ou trois fois la taille des voxels.

Paramètres

spmt: SPMt map ( entrée )
Carte utilisée en entrée
mask: Functional mask ( sortie )
Masque généré
dilation: Réel ( input )
Taille de la dilatation appliquée au masque

Informations techniques

Toolbox : Analyse structurelle

Niveau d'utilisateur : 2

Identifiant : MaskFromSPMt

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/structural_analysis/processes/volume_based/functional/MaskFromSPMt.py

Supported file formats :

spmt :
gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image
mask :
gz compressed NIFTI-1 image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image