Mask generation

None

Paramètres

Input_Image: Volume 3D ( entrée )

Channel: Choice ( input )

Threshold_Mode: Choice ( optional, input )

Threshold_Ratio: Réel ( input )

Connected_Components: Entier ( input )

Connected_Components_MinSize: Entier ( input )

Opening_Radius: Réel ( optional, input )

Closing_Radius: Réel ( optional, input )

Output_Directory: Répertoire ( optional, sortie )

Output_Image: Volume 3D ( sortie )

Informations techniques

Toolbox : BrainRAT

Niveau d'utilisateur : 3

Identifiant : MaskGeneration

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/brainrat/processes/toolbox/MaskGeneration.py

Supported file formats :

Input_Image :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

Output_Directory :

Répertoire, Répertoire

Output_Image :

gz compressed NIFTI-1 image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image