Analyse d'histogramme

Extrait de l'histogramme d'une IRM T1 les moyennes et les écarts types des matières grises et blanches

Description

Cette nouvelle analyse de l'histogramme ne peut être utilisée qu'après la nouvelle correction de biais. Elle permet d'éviter certaines faiblesses de la précédente lorsque l'histogramme présente un grand pic de graisse.

Paramètres

t1mri_nobias: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )

use_hfiltered: Booléen ( input )

hfiltered: T1 MRI Filtered For Histo ( optional, entrée )

use_wridges: Booléen ( input )

white_ridges: T1 MRI White Matter Ridges ( optional, entrée )

undersampling: Choice ( input )

histo_analysis: Analyse d'histogramme ( sortie )

histo: Histogramme ( sortie )

fix_random_seed: Booléen ( input )

Informations techniques

Toolbox : Morphologist

Niveau d'utilisateur : 0

Identifiant : NobiasHistoAnalysis

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components/NobiasHistoAnalysis.py

Supported file formats :

t1mri_nobias :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

hfiltered :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

white_ridges :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

histo_analysis :

Analyse d'histogramme, Analyse d'histogramme

histo :

Histogramme, Histogramme