Réorientation de l'anatomie

None

Paramètres

t1mri: Raw T1 MRI ( entrée )

output_t1mri: Raw T1 MRI ( sortie )

transformation: Transform Raw T1 MRI to Talairach-MNI template-SPM ( entrée )

output_transformation: Transform Raw T1 MRI to Talairach-MNI template-SPM ( sortie )

commissures_coordinates: Commissure coordinates ( optional, entrée )

output_commissures_coordinates: Commissure coordinates ( optional, sortie )

allow_flip_initial_MRI: Booléen ( input )

Informations techniques

Toolbox : Morphologist

Niveau d'utilisateur : 0

Identifiant : reorientAnatomy

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/registration/reorientAnatomy.py

Supported file formats :

t1mri :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

output_t1mri :

gz compressed NIFTI-1 image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

transformation :

Transformation matrix, Transformation matrix

output_transformation :

Transformation matrix, Transformation matrix

commissures_coordinates :

Commissure coordinates, Commissure coordinates

output_commissures_coordinates :

Commissure coordinates, Commissure coordinates