Extraction de la surface sphérique d'un hémisphère

Crée un maillage d'un ou deux hémisphères

Description

Cette procédure crée un maillage de chacun des hémisphères cérébraux. Elle inclue un prétraitement qui ouvre les sillons afin de faciliter la lecture de la surface corticale.
Le maillage de cette nouvelle version est sphérique, ce qui autorise le gonflement pour le déplisser.

Paramètres

Side: Choice ( input )

Gauche, Droit, ou les Deux Hémisphères

mri_corrected: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )

split_mask: Séparation du masque du cerveau ( entrée )

left_hemi_cortex: Left CSF+GREY Mask ( entrée )

right_hemi_cortex: Right CSF+GREY Mask ( entrée )

left_hemi_mesh: Left Hemisphere Mesh ( sortie )

right_hemi_mesh: Right Hemisphere Mesh ( sortie )

fix_random_seed: Booléen ( input )

Informations techniques

Toolbox : Morphologist

Niveau d'utilisateur : 2

Identifiant : GetSphericalHemiSurface

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components_obsolete/segmentation/GetSphericalHemiSurface.py

Supported file formats :

mri_corrected :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

split_mask :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

left_hemi_cortex :

gz compressed NIFTI-1 image, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, VIDA image, XBM image, XPM image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

right_hemi_cortex :

gz compressed NIFTI-1 image, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, VIDA image, XBM image, XPM image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

left_hemi_mesh :

GIFTI file, GIFTI file, Maillage MESH, MNI OBJ mesh, PLY mesh, Maillage TRI

right_hemi_mesh :

GIFTI file, GIFTI file, Maillage MESH, MNI OBJ mesh, PLY mesh, Maillage TRI