Compute and Split Brain Mask

None

Paramètres

input_parcellation: P:EM Parcellation ( optional, entrée )

input_lateral: P:Atlas Registered Lateralization ( optional, entrée )

input_hierarchy: P:Atlas Hierarchy ( optional, entrée )

specie: OpenChoice ( optional, input )

small_radius: Réel ( optional, input )

output_brain_mask: Masque du cerveau ( optional, sortie )

output_brain_split: Séparation du masque du cerveau ( optional, sortie )

Informations techniques

Toolbox : Primatologist

Niveau d'utilisateur : 0

Identifiant : primate_BrainSegmentation

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/primatologist/processes/blocks/primate_BrainSegmentation.py

Supported file formats :

input_parcellation :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

input_lateral :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

input_hierarchy :

Hiérarchie, Hiérarchie

output_brain_mask :

gz compressed NIFTI-1 image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

output_brain_split :

gz compressed NIFTI-1 image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image