Validation_3 Brain Mask from T1 MRI

Validation of Vip Get Brain

Description

Cet outil fusionne la segmentation avec l'IRM corrigée du biais de manière à simplifier la vérification du résultat. La visualisation obtenue est la suivante:

Si tout vous semble correct, vous pouvez l'indiquer à brainvisa en mettant validation à Lock (+ execute). Cette commande crée le fichier brain_dionysos.lock. S'il existe, la segmentation ne sera plus jamais effectuée, même par la procédure Correction Brain Mask from T1 MRI

Parameters

brain_mask: T1 Brain Mask ( input )

mri_corrected: T1 MRI Bias Corrected ( input )

validation: Choice ( input )

Technical information

Toolbox : Morphologist

User level : 0

Identifier : AnaT1toBrainMaskValidation

File name : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components_obsolete/validation/AnaT1toBrainMaskValidation.py

Supported file formats :

brain_mask :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Directory, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

mri_corrected :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, DICOM image, Directory, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, Ventana bif, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image