ClearMap resampling

Module de rééchantillonnage

Paramètres

input: Volume 3D ( entrée )

processes: Entier ( input )

Nombre d'éxécutions lancées en parallèle

processMethod: Choice ( input )

'None' pour exécuter en série, 'parallel' pour éxécuter en parallèle

resolutionSource: ListOf( Réel ) ( input )

Résolution de la source d'entrée : valeurs données pour un zoom de 0.8x sur un microscope LaVisionavec une lentille 2x : 4.0625 4.0625 3.0

resolutionSink: ListOf( Réel ) ( input )

Résolution voulue en sortie

interpolation: Choice ( input )

Méthode d'interpolation choisie : 'linear' pour 'linéaire' ou 'nearestPixel' pour 'plus proche voisin'

orientation: ListOf( Entier ) ( optional, input )

Triplet d'orientation afin d'adapter l'orientation de l'Atas utilisé : 3 entiers relatifs

output: Volume 3D ( sortie )

Informations techniques

Toolbox : Bioprocessing

Niveau d'utilisateur : 3

Identifiant : ClearMapResampling

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/bioprocessing/processes/research/projects/clearmap/ClearMapResampling.py

Supported file formats :

input :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

output :

gz compressed NIFTI-1 image, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, VIDA image, XBM image, XPM image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image