Elastix Registration

Réalise le recallage de l'image avec les paramètres d'alignement Elastix

Paramètres

test: Volume 3D ( entrée )

Image à transformer

ElastixTransformationDirectory: Répertoire ( entrée )

Dossier de stockage des paramètre d'alignement Elastix

output: Répertoire ( sortie )

sink: Volume 3D ( sortie )

Nom et destination de l'image recallée

Informations techniques

Toolbox : Bioprocessing

Niveau d'utilisateur : 3

Identifiant : ElastixRegistration

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/bioprocessing/processes/research/projects/clearmap/ElastixRegistration.py

Supported file formats :

test :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

ElastixTransformationDirectory :

Répertoire, Répertoire

output :

Répertoire, Répertoire

sink :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image