3D hierarchical analysis

None

Paramètres

Input_3dImage: Volume 3D ( entrée )

Input_3dImage_ROI: Volume 3D ( entrée )

Input_Hierarchy: Hiérarchie ( optional, entrée )

Volume: Booléen ( input )

Percent_Amount_Of_Staining: Booléen ( input )

Output_Directory: Répertoire ( optional, sortie )

Output_Csv: CSV file ( sortie )

Informations techniques

Toolbox : BrainRAT

Niveau d'utilisateur : 3

Identifiant : Volume3DHierarchicalStatisticGeneration

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/brainrat/processes/pmianalysis/Volume3DHierarchicalStatisticGeneration.py

Supported file formats :

Input_3dImage :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

Input_3dImage_ROI :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

Input_Hierarchy :

Hiérarchie, Hiérarchie

Output_Directory :

Répertoire, Répertoire

Output_Csv :

CSV file, CSV file