Fiber Oversampler

les fibres sont échantillonnées pour attacher leur extrémité à la surface corticale.

Description

Les fibres sont rééchantillonnées afin de les associer au maillage.
Exemple inputs/outputs:

semilabeled_fibers:              /my/path/database_brainvisa/subjects/001/diffusion/default_acquisition/default_analysis/
                                 default_tracking_session/ connectivity_parcellation/avg/studyA/lh.postcentral/filteredTracts/
                                 001_studyA_lh.postcentral_outsideFibersOfCortex_20to500mm.bundles  

oversampled_semilabeled_fibers:              /my/path/database_brainvisa/subjects/001/diffusion/default_acquisition/default_analysis/
                                 default_tracking_session/ connectivity_parcellation/avg/studyA/lh.postcentral/filteredTracts/
                                 001_studyA_lh.postcentral_outsideFibersOfCortex_20to500mm_oversampled.bundles  

Paramètres

semilabeled_fibers: Filtered Fascicles Bundles ( entrée )

Ensemble des fibres ayant qu'une seule extrémité associée à un point du maillage

oversampled_semilabeled_fibers: Filtered Fascicles Bundles ( sortie )

Ensemble des fibres suréchantillonnée à partir des fibres ayant qu'une seule extrémité associée à un point du maillage

Informations techniques

Toolbox : Constellation

Niveau d'utilisateur : 2

Identifiant : constel_fiber_oversampler

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/constellation/processes/individual_pipelines/tools_connectomist/constel_fiber_oversampler.py

Supported file formats :

semilabeled_fibers :

Aims bundles, Aims bundles, Mrtrix tracts, Trackvis tracts

oversampled_semilabeled_fibers :

Aims bundles, Aims bundles