Smoothing of the Individual Matrix.

Lissage de la matrice de connectivity complète résultant de la somme des deux matrices sparses.

Description

Il y a deux matrices, une pour chaque type de fibres. ('labeled fibers' ou 'semilabeled fibers'). Elles sont sommées pour construire la matrice de connectivitécomplète (label vertices, cortex vertices). Le lissage de la matrice sparse est réalisé en utilisant l'équation de la chaleur, avec la géométrie du maillage. Le lissage est appliqué sur chaque ligne, chaque ligne étant un profile du maillage.

Paramètres

regions_nomenclature: Nomenclature ROIs File ( entrée )

Nomenclature of the cortical parcellation used to partition the study.
Example : Freesurfer Desikan_Killiany Atlas

region: OpenChoice ( input )

The study region based on regions_nomenclature file.

complete_individual_matrix: Matrice de connectivité ( entrée )

Connectivity matrix after preprocessing.

individual_white_mesh: White Mesh ( entrée )

Freesurfer white-grey interface of the cortex.
Should not be inflated.

regions_parcellation: ROI Texture ( entrée )

Cortical parcellation used to partition the study.
Example : Freesurfer Desikan_Killiany Atlas (?h.aparc.annot).

smoothing: Réel ( input )

Degré du smoothing en millimètre.

complete_matrix_smoothed: Matrice de connectivité ( sortie )

Smoothed connectivity matrix.

Informations techniques

Toolbox : Constellation

Niveau d'utilisateur : 2

Identifiant : constel_smooth_matrix

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/constellation/processes/individual_pipelines/individual_sub_pipeline/tools/constel_smooth_matrix.py

Supported file formats :

regions_nomenclature :

Text file, Text file

complete_individual_matrix :

Sparse Matrix, Sparse Matrix

individual_white_mesh :

GIFTI file, GIFTI file, Maillage MESH, MNI OBJ mesh, PLY mesh, Maillage TRI

regions_parcellation :

GIFTI file, GIFTI file, Texture

complete_matrix_smoothed :

Sparse Matrix, Sparse Matrix