Gonflement de la surface corticale

Gonflement de l'interface WM/GM

Description

Cette moulinette permet de "gonfler" la surface interface entre matière grise et matière blanche, essentiellement pour des raisons de visualisation. On peut sauver une partie de la séquence de visualisation si on le désire. La séquence contient alors t=0, t=10, t=20, t=40, t=80, etc..., t=last_iteration. Une texture contenant la courbure moyenne de la surface originale est également calculée et écrite dans 'meanCurvature.tex' pour pouvoir localiser les sillons sur la surface gonflée. Vous pouvez fusionner cette texture avec une texture fonctionnelle dans Anatomist afin de créer une texture 2D. La texture fonctionnelle peut être calculée en fusionnant la surface corticale initiale et le volume 3D de la SPM (vous avez d'ailleurs la possibilité de régler divers paramètres controlant cette fusion).

Fig 1: Avant

Fig 2: Après

Paramètres

input_mesh: Maillage de la matière blanche d'un hémisphère ( entrée )

.tri ou .mesh contenant la surface à gonfler

output_mesh: Inflated Hemisphere White Mesh ( sortie )

résultat du gonflement dans un .mesh

curvature_texture: White Curvature Texture ( sortie )

Texture contenant la courbure moyenne de la surface "input_mesh". Le chemin/nom doit être rentré à la main (pour l'instant).

iterations: Entier ( input )

Nombre d'itérations nécessaires

normal_force: Réel ( input )

Poids de la force de gonflement selon la normale à la surface.

spring_force: Réel ( input )

Poids de la force "ressort" qui préserve l'intégrité du maillage et évite les distorsions de distance sur la surface.

smoothing_force: Réel ( input )

Poids de la force de lissage (la plus importante).

save_sequence: Booléen ( input )

Veut-on sauver la séquence de gonflement ou seulement le résultat final.

Informations techniques

Toolbox : Morphologist

Niveau d'utilisateur : 0

Identifiant : inflateCorticalSurface

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/surface/inflateCorticalSurface.py

Supported file formats :

input_mesh :

GIFTI file, GIFTI file, Maillage MESH, MNI OBJ mesh, PLY mesh, Maillage TRI

output_mesh :

GIFTI file, GIFTI file, Maillage MESH, MNI OBJ mesh, PLY mesh, Maillage TRI

curvature_texture :

GIFTI file, GIFTI file, Texture