C'est ici que se trouvent les composants du pipeline Morphologist.
Le développement de ce pipeline visait à augmenter la robustesse des précédents (2007, 2004) mais aussi à apporter de nouvelles fonctionnalités, comme un maillage sphérique de l'interface externe du cortex. Jusqu'à présent, nous nous sommes surtout concentrés sur la robustesse. Notre manière de procéder a consisté à réunir une centaine d'examens provenant d'un peu partout dans le monde. Ces examens ont surtout été sélectionnés pour leur faible qualité en termes de contraste, signal sur bruit et inhomogénéités spatiales. Chaque fois que nous procédons à un changement (ajustement de paramètre ou nouvel algorithme), nous relançons le pipeline sur l'ensemble des données et nous vérifions les résultats visuellement.