Nuclear Imaging 
Pour avoir cette documentation dans une page web : clic droit -> open in a web browser. Cela vous permettra de lire facilement la documentation tout en utilisant braivisa.
Il existe différents modes dans brainvisa, je vous conseille dans un premier temps d'utiliser le mode basic qui a une interface plus simple.
Pour cela menu brainvisa -> preferences -> brainvisa -> userLevel -> choisir Basic.
Plus d'options sont disponibles en mode avancé ou expert.
Création d'une base de donnée :
note : Je vous conseille vivement de lire les quelques lignes de quick start avant de continuer : An introduction to BrainVISA
- menu brainvisa -> preferences -> databases
- bouton add : choisir le dossier qui contiendra la Base de données ( ex. de nom de dossier : KLS_brainvisaDataBase )
- bouton OK, puis brainvisa demande une mise à jour de la base de donnée : cliquer sur update.
- note : il est préférable de n'avoir qu'une seule base de données sélectionnée pour éviter les erreurs de manipulation. Toute fois si vous souhaitez avoir une base différente entre entrée (pour l'import) et en sortie des traitements, il vous faudra sélectionner les deux base de données.
Utiliser un pipeline :
- icône nuclear Imaging -> nom du pipeline... : Un clic simple vous permet de voir la document dans le panneau de droite (un schéma récapitule les différents étapes de traitement que va subir l'image). Un double clic ouvre le traitement.
- cliquer sur le point de départ du pipeline (en haut à gauche) pour avoir le tableau de bord avec tous les paramètres du pipeline.
Importer une image :
- Pour importer des dicoms : icône nuclear Imaging -> dossier import -> import Dicoms of One Subject.
- Pour importer des images (nii, img..) : icône nuclear Imaging -> dossier import -> import images of One Subject.
Traiter une image Pet/Spect ( normalisation vers MNI) :
Traiter une image PET avec l'IRM T1 entière :
Traiter une image PET avec l'IRM T1 segmentée :
moana