Validation_3 Brain Mask from T1 MRI

Validation of Vip Get Brain

Description

Cet outil fusionne la segmentation avec l'IRM corrigée du biais de manière à simplifier la vérification du résultat. La visualisation obtenue est la suivante:

Si tout vous semble correct, vous pouvez l'indiquer à brainvisa en mettant validation à Lock (+ execute). Cette commande crée le fichier brain_dionysos.lock. S'il existe, la segmentation ne sera plus jamais effectuée, même par la procédure Correction Brain Mask from T1 MRI

Parameters

brain_mask: T1 Brain Mask ( input )

mri_corrected: T1 MRI Bias Corrected ( input )

validation: Choice ( input )

Technical information

Toolbox : Morphologist

User level : 0

Identifier : AnaT1toBrainMaskValidation

File name : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components_obsolete/validation/AnaT1toBrainMaskValidation.py

Supported file formats :

brain_mask :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Directory, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

mri_corrected :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Directory, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image