Extraction de la surface ouverte d'un hémisphère

Crée un maillage d'un ou deux hémisphères

Description

Cette procédure crée un maillage de chacun des hémisphères cérébraux. Elle inclue un prétraitement qui ouvre les sillons afin de faciliter la lecture de la surface corticale.
ATTENTION, le maillage issu de cette procédure n'a pas de raison d'avoir une topologie sphérique. Il ne devrait donc pas être gonflé pour le déplisser. Un maillage sphérique de l'interface gris/blanc est fourni par une autre procédure.

Nous espérons fournir un maillage sphérique de l'interface gris/LCR dans un avenir proche...

Exemple de résultat:

Paramètres

Side: Choice ( input )

mri_corrected: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )

split_mask: Séparation du masque du cerveau ( entrée )

left_hemi_cortex: Left CSF+GREY Mask ( entrée )

right_hemi_cortex: Right CSF+GREY Mask ( entrée )

left_hemi_mesh: Left Hemisphere Mesh ( sortie )

right_hemi_mesh: Right Hemisphere Mesh ( sortie )

Informations techniques

Toolbox : Morphologist

Niveau d'utilisateur : 2

Identifiant : AnaGetOpenedHemiSurface

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components_obsolete/segmentation/AnaGetOpenedHemiSurface.py

Supported file formats :

mri_corrected :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

split_mask :

gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

left_hemi_cortex :

gz compressed NIFTI-1 image, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, VIDA image, XBM image, XPM image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

right_hemi_cortex :

gz compressed NIFTI-1 image, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, GIF image, GIS image, JPEG image, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, TIFF image, TIFF(.tif) image, VIDA image, XBM image, XPM image, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image

left_hemi_mesh :

GIFTI file, GIFTI file, Maillage MESH, MNI OBJ mesh, PLY mesh, Maillage TRI

right_hemi_mesh :

GIFTI file, GIFTI file, Maillage MESH, MNI OBJ mesh, PLY mesh, Maillage TRI