Validation de Vip Split Brain
Cet outil fusionne la segmentation avec l'IRM corrigée du biais de manière à simplifier la vérification du résultat. La visualisation obtenue est la suivante:
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Si tout vous semble correct, vous pouvez l'indiquer à brainvisa en mettant validation à Yes (+ execute). Cette commande crée le fichier voronoi.loc. S'il existe, la segmentation ne sera plus jamais effectuée, même par la procédure Correction Split Brain from Brain Mask
split_mask: Séparation du masque du cerveau ( entrée )
mri_corrected: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )Le résultat de la correction de biais
validation: Choice ( input )validation de la segmentation
Toolbox : Morphologist
Niveau d'utilisateur : 0
Identifiant :
AnaSplitBrainfromBrainMaskValidation
Nom de fichier :
brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components_obsolete/validation/AnaSplitBrainfromBrainMaskValidation.py
Supported file formats :
split_mask :gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 imagemri_corrected :gz compressed NIFTI-1 image, Aperio svs, BMP image, DICOM image, Répertoire, ECAT i image, ECAT v image, FDF image, FreesurferMGH, FreesurferMGZ, GIF image, GIS image, Hamamatsu ndpi, Hamamatsu vms, Hamamatsu vmu, JPEG image, Leica scn, MINC image, NIFTI-1 image, PBM image, PGM image, PNG image, PPM image, SPM image, Sakura svslide, TIFF image, TIFF image, TIFF(.tif) image, TIFF(.tif) image, VIDA image, Ventana bif, XBM image, XPM image, Zeiss czi, gz compressed MINC image, gz compressed NIFTI-1 image