gradient.h

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 */
 
 
#ifndef AIMS_MATH_GRADIENT_H
#define AIMS_MATH_GRADIENT_H
 
 
#include <cartodata/volume/volume.h>
 
enum AimsGradientMethod
{
  AIMS_GRADIENT_CENTRAL,
  AIMS_GRADIENT_DMINUS,
  AIMS_GRADIENT_DPLUS
};
 
 
enum AimsFirstOrderGradient
{
  AIMS_GRADIENT_X,
  AIMS_GRADIENT_Y,
  AIMS_GRADIENT_Z,
  AIMS_GRADIENT_T
};
 
enum AimsSecondOrderGradient
{
  AIMS_GRADIENT_XX,
  AIMS_GRADIENT_XY,
  AIMS_GRADIENT_XZ,
  AIMS_GRADIENT_XT,
  AIMS_GRADIENT_YX,
  AIMS_GRADIENT_YY,
  AIMS_GRADIENT_YZ,
  AIMS_GRADIENT_YT,
  AIMS_GRADIENT_ZX,
  AIMS_GRADIENT_ZY,
  AIMS_GRADIENT_ZZ,
  AIMS_GRADIENT_ZT,
  AIMS_GRADIENT_TX,
  AIMS_GRADIENT_TY,
  AIMS_GRADIENT_TZ,
  AIMS_GRADIENT_TT
};
 
enum AimsThirdOrderGradient
{
  AIMS_GRADIENT_XXX,
  AIMS_GRADIENT_XXY,
  AIMS_GRADIENT_XXZ,
  AIMS_GRADIENT_XXT,
  AIMS_GRADIENT_XYX,
  AIMS_GRADIENT_XYY,
  AIMS_GRADIENT_XYZ,
  AIMS_GRADIENT_XYT,
  AIMS_GRADIENT_XZX,
  AIMS_GRADIENT_XZY,
  AIMS_GRADIENT_XZZ,
  AIMS_GRADIENT_XZT,
  AIMS_GRADIENT_XTX,
  AIMS_GRADIENT_XTY,
  AIMS_GRADIENT_XTZ,
  AIMS_GRADIENT_XTT,
  AIMS_GRADIENT_YXX,
  AIMS_GRADIENT_YXY,
  AIMS_GRADIENT_YXZ,
  AIMS_GRADIENT_YXT,
  AIMS_GRADIENT_YYX,
  AIMS_GRADIENT_YYY,
  AIMS_GRADIENT_YYZ,
  AIMS_GRADIENT_YYT,
  AIMS_GRADIENT_YZX,
  AIMS_GRADIENT_YZY,
  AIMS_GRADIENT_YZZ,
  AIMS_GRADIENT_YZT,
  AIMS_GRADIENT_YTX,
  AIMS_GRADIENT_YTY,
  AIMS_GRADIENT_YTZ,
  AIMS_GRADIENT_YTT,
  AIMS_GRADIENT_ZXX,
  AIMS_GRADIENT_ZXY,
  AIMS_GRADIENT_ZXZ,
  AIMS_GRADIENT_ZXT,
  AIMS_GRADIENT_ZYX,
  AIMS_GRADIENT_ZYY,
  AIMS_GRADIENT_ZYZ,
  AIMS_GRADIENT_ZYT,
  AIMS_GRADIENT_ZZX,
  AIMS_GRADIENT_ZZY,
  AIMS_GRADIENT_ZZZ,
  AIMS_GRADIENT_ZZT,
  AIMS_GRADIENT_ZTX,
  AIMS_GRADIENT_ZTY,
  AIMS_GRADIENT_ZTZ,
  AIMS_GRADIENT_ZTT,
  AIMS_GRADIENT_TXX,
  AIMS_GRADIENT_TXY,
  AIMS_GRADIENT_TXZ,
  AIMS_GRADIENT_TXT,
  AIMS_GRADIENT_TYX,
  AIMS_GRADIENT_TYY,
  AIMS_GRADIENT_TYZ,
  AIMS_GRADIENT_TYT,
  AIMS_GRADIENT_TZX,
  AIMS_GRADIENT_TZY,
  AIMS_GRADIENT_TZZ,
  AIMS_GRADIENT_TZT,
  AIMS_GRADIENT_TTX,
  AIMS_GRADIENT_TTY,
  AIMS_GRADIENT_TTZ,
  AIMS_GRADIENT_TTT
};
 
 
 
template <class C>
class AimsGradient
{ protected :
    int _type;
 
  public :
  AimsGradient(int type=AIMS_GRADIENT_CENTRAL) { _type = type;}
  virtual ~ AimsGradient() {}
 
  carto::VolumeRef<C> X(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> Y(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> Z(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> T(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
 
  carto::VolumeRef<C> XX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
    
  carto::VolumeRef<C> XXX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XXY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XXZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XXT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XYX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XYY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XYZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XYT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XZX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XZY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XZZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XZT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XTX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XTY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XTZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> XTT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YXX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YXY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YXZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YXT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YYX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YYY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YYZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YYT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YZX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YZY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YZZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YZT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YTX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YTY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YTZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> YTT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZXX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZXY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZXZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZXT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZYX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZYY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZYZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZYT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZZX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZZY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZZZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZZT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZTX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZTY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZTZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> ZTT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TXX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TXY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TXZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TXT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TYX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TYY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TYZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TYT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TZX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TZY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TZZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TZT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TTX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TTY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TTZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
  carto::VolumeRef<C> TTT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data);
};
 
 
 
 
/* gradient 1st order */
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::X(
  const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{
  int    beginx=0,endx=0,offx1=0,offx2=0;
  float  divx=0;
  std::vector<int> dims = data->getSize();
  std::vector<float> vs = data->getVoxelSize();
 
  carto::VolumeRef<C> grad( dims, data->getBorders() );
  grad = (C)0;
  grad.fillBorder(0);
  grad.copyHeaderFrom( data->header() );
 
  switch (_type)
  {
  case AIMS_GRADIENT_CENTRAL :
    beginx = 1;
    endx = dims[0]-1;
    offx1 = 1;
    offx2 = 1;
    divx = 2 * vs[0];
    break;
  case AIMS_GRADIENT_DMINUS  :
    beginx = 1;
    endx = dims[0];
    offx1 = 1;
    offx2 = 0;
    divx = vs[0];
    break;
  case AIMS_GRADIENT_DPLUS   :
    beginx = 0;
    endx = dims[0]-1;
    offx1 = 0;
    offx2 = 1;
    divx = vs[0];
    break;
  }
 
  for (int t=0;t<dims[3];t++)
    for (int z=0;z<dims[2];z++)
      for (int y=0;y<dims[1];y++)
        for (int x=beginx;x<endx;x++)
          grad(x,y,z,t) = (C)( ((float)data->at(x+offx2,y,z,t) -
                                (float)data->at(x-offx1,y,z,t)) / divx);
  return grad;
}
 
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::Y(
  const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{
  int    beginy=0,endy=0,offy1=0,offy2=0;
  float  divy=0;
  std::vector<int> dims = data->getSize();
  std::vector<float> vs = data->getVoxelSize();
 
  carto::VolumeRef<C> grad( dims, data->getBorders() );
  grad = (C)0;
  grad.fillBorder(0);
  grad.copyHeaderFrom( data->header() );
 
  switch (_type)
  { case AIMS_GRADIENT_CENTRAL : beginy = 1;endy = dims[1]-1;
                                 offy1=1;offy2=1;divy=2 * vs[1];break;
    case AIMS_GRADIENT_DMINUS  : beginy = 1;endy = dims[1]  ;
                                 offy1=1;offy2=0;divy=vs[1];break;
    case AIMS_GRADIENT_DPLUS   : beginy = 0;endy = dims[1]-1;
                                 offy1=0;offy2=1;divy=vs[1];break;
  }
 
  for (int t=0;t<dims[3];t++)
    for (int z=0;z<dims[2];z++)
      for (int y=beginy;y<endy;y++)
        for (int x=0;x<dims[0];x++)
          grad(x,y,z,t) = (C)(((float)data->at(x,y+offy2,z,t) -
                               (float)data->at(x,y-offy1,z,t)) / divy);
  return grad;
}
 
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::Z(
  const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{
  int    beginz=0,endz=0,offz1=0,offz2=0;
  float  divz=0;
  std::vector<int> dims = data->getSize();
  std::vector<float> vs = data->getVoxelSize();
 
  carto::VolumeRef<C> grad( dims, data->getBorders() );
  grad = (C)0;
  grad.fillBorder(0);
  grad.copyHeaderFrom( data->header() );
 
  switch (_type)
  { case AIMS_GRADIENT_CENTRAL : beginz = 1;endz = dims[2]-1;
                                 offz1=1;offz2=1;divz=2 * vs[2];break;
    case AIMS_GRADIENT_DMINUS  : beginz = 1;endz = dims[2]  ;
                                 offz1=1;offz2=0;divz=vs[2];break;
    case AIMS_GRADIENT_DPLUS   : beginz = 0;endz = dims[2]-1;
                                 offz1=0;offz2=1;divz=vs[2];break;
  }
 
  for (int t=0;t<dims[3];t++)
    for (int z=beginz;z<endz;z++)
      for (int y=0;y<dims[1];y++)
        for (int x=0;x<dims[0];x++)
          grad(x,y,z,t) = (C)(((float)data->at(x,y,z+offz2,t) -
                               (float)data->at(x,y,z-offz1,t)) / divz);
  return grad;
}
 
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::T(
  const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{
  int    begint=0,endt=0,offt1=0,offt2=0;
  float  divt=0;
  std::vector<int> dims = data->getSize();
  std::vector<float> vs = data->getVoxelSize();
 
  carto::VolumeRef<C> grad( dims, data->getBorders() );
  grad = (C)0;
  grad.fillBorder(0);
  grad.copyHeaderFrom( data->header() );
 
  switch (_type)
  { case AIMS_GRADIENT_CENTRAL : begint = 1;endt = dims[3]-1;
                                 offt1=1;offt2=1;divt=2 * vs[3];break;
    case AIMS_GRADIENT_DMINUS  : begint = 1;endt = dims[3]  ;
                                 offt1=1;offt2=0;divt=vs[3];break;
    case AIMS_GRADIENT_DPLUS   : begint = 0;endt = dims[3]-1;
                                 offt1=0;offt2=1;divt=vs[3];break;
  }
 
  for (int t=begint;t<endt;t++)
    for (int z=0;z<dims[2];z++)
      for (int y=0;y<dims[1];y++)
        for (int x=0;x<dims[0];x++)
          grad(x,y,z,t) = (C)(((float)data->at(x,y,z,t+offt2) -
                               (float)data->at(x,y,z,t-offt1)) / divt);
  return grad;
}
 
 
/* gradient 2nd order */
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(X(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(Y(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(Z(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(T(data)));
}
 
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::YX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(Y(X(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::YY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(Y(Y(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::YZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(Y(Z(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::YT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(Y(T(data)));
}
 
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::ZX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(Z(X(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::ZY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(Z(Y(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::ZZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(Z(Z(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::ZT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(Z(T(data)));
}
 
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::TX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(T(X(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::TY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(T(Y(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::TZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(T(Z(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::TT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(T(T(data)));
}
 
 
/* gradient 3rd order */
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XXX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(XX(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XXY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(XY(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XXZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(XZ(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XXT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(XT(data)));
}
 
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XYX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(YX(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XYY(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(YY(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XYZ(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(YZ(data)));
}
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XYT(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
{ return(X(YT(data)));
}
 
 
template <class C> inline
carto::VolumeRef<C> AimsGradient<C>::XZX(const carto::rc_ptr<carto::Volume<C> > &data)
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