Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

- a -

• addSegment() : aims::IsoLine
• AimsMeshLaplacian_meridian() : aims::CorticalReferential
• are_they_neighbours() : aims::SulcusCorticalSnake

- b -

• Bifurcation() : surf::Bifurcation
• Blob() : surf::Blob
• BuildSimilarityCliques() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• BuildSimilarityCliques3D() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• BuildSites() : SurfaceBased_StructuralAnalysis

- c -

• cingularPoint() : aims::CorticalReferential
• Clique() : Clique, surf::Clique
• Comp() : Comp
• compute() : aims::MeshPointDistance, aims::MeshPointNeighborhoodFromDistance
• compute_curv() : aims::SulcusCorticalSnake
• compute_energy() : aims::SulcusCorticalSnake
• compute_snake() : aims::SulcusCorticalSnake
• compute_snake_at_1_resolution() : aims::SulcusCorticalSnake
• ComputeEdges() : aims::ConformalMapping
• computeEnergy() : Clique
• computeGraphDijkstra() : aims::SulcusCorticalSnake
• ComputeHarmonicCoefficients() : aims::ConformalMapping
• computeListLabelProjectionsBasins() : SulcalLinesGeodesic
• computeNeighbours() : aims::MeshPointDistance, aims::MeshPointNeighborhoodFromDistance
• computeShortestPath() : aims::SulcusCorticalSnake
• ConformalMap() : aims::ConformalMapping
• ConformalMapping() : aims::ConformalMapping
• ConnectMeshPath() : aims::ConnectMeshPath< T >
• constraintCleaning() : aims::SulcusCleaner
• constraintPreprocess() : aims::CorticalReferential
• ConvertSSBlobsToSites() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• CorticalReferential() : aims::CorticalReferential
• createDistanceTexture() : aims::SulcusCorticalSnake
• createNewVertex() : aims::IsoLine
• curvature_energy() : aims::SulcusCorticalSnake_energy

- d -

• define_extremities() : aims::SulcusCorticalSnake
• define_new_middle_point() : aims::SulcusCorticalSnake
• diffusionLatitude() : aims::CorticalReferential
• diffusionLatitudeRelax() : aims::CorticalReferential
• diffusionLongitude() : aims::CorticalReferential
• diffusionLongitudeRelax() : aims::CorticalReferential

- e -

• elastic_energy() : aims::SulcusCorticalSnake_energy

- f -

• floodFillIter() : SulcalLinesGeodesic

- g -

• geodesic_distance() : aims::SulcusCorticalSnake_energy
• get2DBoundingBox() : surf::Blob, surf::GreyLevelBlob, surf::ScaleSpaceBlob
• getAimsEllipsoid() : surf::Blob, surf::GreyLevelBlob
• getAimsEllipsoidAtMaxNode() : surf::GreyLevelBlob
• getAimsMesh() : surf::Blob
• getAimsSphereAtMaxNode() : surf::Blob
• getBackup() : StructuralAnalysis_Validation
• getBlobBarycenter() : surf::Blob
• getBlobBarycenterFromMesh() : surf::Blob
• getBlobBarycenterOnAPlane() : surf::Blob
• getBlobBarycenterOnASphere() : surf::Blob
• getCaracSample() : StructuralAnalysis_Validation
• getClusterEnergy() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• getCompConn() : StructuralAnalysis_Validation
• getCompConnVector() : StructuralAnalysis_Validation
• getComponent() : StructuralAnalysis_Validation
• GetConformalMapping() : aims::ConformalMapping
• getGlobalFromLocalNodes() : surf::Region
• getGlobalFromLocalTexture() : surf::Region
• getGlobalTexture() : surf::Region
• getIntraPSWeight() : Clique
• getLabelEnergy() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• getLocalFromGlobalTexture() : surf::Region
• getLongueur() : aims::GraphPath< Val >
• getMaximumNode() : surf::Blob
• getNodesFromBlob() : surf::Blob
• getRankPercentile() : StructuralAnalysis_Validation
• GetSimilarityCliquesFromSSBCliques() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• getTotalEnergy() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• GetTuetteMapping() : aims::ConformalMapping
• getTypeEnergy() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• GraphPath() : aims::GraphPath< Val >
• GreyLevelBlob() : surf::GreyLevelBlob

- h -

• HarmonicEnergy() : aims::ConformalMapping

- i -

• importGraphCliquesFromSSBCliques() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• importGraphNodesAndCliques() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• importGraphNodesFromBlobs() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• includeNeighbors() : aims::MeshPointNeighborhoodFromDistance
• Initialization() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• is_it_in_the_vector() : aims::SulcusCorticalSnake
• isInTriangle() : aims::Mesh2mesh
• IsoLine() : aims::IsoLine

- l -

• latitudePropagation() : aims::CorticalReferential
• longitudePropagation() : aims::CorticalReferential

- m -

• makeLine() : aims::IsoLine
• makeTubes() : aims::IsoLine
• Mesh2mesh() : aims::Mesh2mesh
• MeshDistance_adapt() : aims::SulcusCorticalSnake, aims::SulcusCorticalSnake_energy
• MeshDistance_adapt_local() : aims::SulcusCorticalSnake
• MeshDistance_adapt_tex() : aims::SulcusCorticalSnake
• MeshPointDistance() : aims::MeshPointDistance
• MeshPointNeighborhoodFromDistance() : aims::MeshPointNeighborhoodFromDistance
• moveMeshToPlaneAtlas() : surf::Blob, surf::GreyLevelBlob
• moveMeshToSphericalAtlas() : surf::Blob, surf::GreyLevelBlob

- n -

• nbcombinaisons() : StructuralAnalysis_Validation
• nearestNeighbour() : aims::Mesh2mesh
• noLabelsZones() : SurfaceBased_StructuralAnalysis

- o -

• operator()() : Comp, ltSurfBlobs

- p -

• preprocess() : aims::SulcusCleaner
• PrintCliquesNumbers() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• printFile() : StructuralAnalysis_Validation
• probaMap() : SulcalLinesGeodesic
• process() : aims::CorticalReferential, aims::GraphPath< Val >
• process_list() : aims::SulcusCorticalSnake
• processConstraints() : aims::SulcusCleaner

- r -

• readData() : GroupData
• refine_vector() : aims::SulcusCorticalSnake
• Region() : surf::Region
• regionLabelsZones() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• remeshSourceToTarget() : aims::Mesh2mesh
• Run() : Anneal, ICM, SWC
• run() : aims::ConnectMeshPath< T >, SulcalLinesGeodesic
• Run2() : SWC

- s -

• saveSignificanceInfo() : StructuralAnalysis_Validation
• ScaleSpaceBlob() : surf::ScaleSpaceBlob
• sendTextureToTarget() : aims::Mesh2mesh
• setModelParameters() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• setParameters() : Clique
• setVertices() : aims::IsoLine
• ShortSummaryLabels() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• Site() : Site
• Step() : Anneal, ICM
• stop_condition_1_resolution() : aims::SulcusCorticalSnake
• stop_total() : aims::SulcusCorticalSnake
• storeCoordinates() : SubjectData
• storeData() : SubjectData
• StoreSignificanceToGraph() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• StoreToGraph() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• StructuralAnalysis_Validation() : StructuralAnalysis_Validation
• SubjectData() : SubjectData
• SubjectPaths() : SubjectPaths
• SulcalLinesGeodesic() : SulcalLinesGeodesic
• SulcusCleaner() : aims::SulcusCleaner
• SulcusCorticalSnake() : aims::SulcusCorticalSnake
• SulcusCorticalSnake_energy() : aims::SulcusCorticalSnake_energy
• SummaryLabels() : SurfaceBased_StructuralAnalysis
• SurfaceBased_StructuralAnalysis() : SurfaceBased_StructuralAnalysis

- t -

• texBinarizeF2S() : SulcalLinesGeodesic
• texBinarizeS2S() : SulcalLinesGeodesic
• texConnectedComponent() : SulcalLinesGeodesic
• total_energy() : aims::SulcusCorticalSnake_energy
• treat_list_point() : aims::SulcusCorticalSnake
• TuetteEnergy() : aims::ConformalMapping
• TuetteMap() : aims::ConformalMapping

- u -

• updateEnergy() : Clique
• updateLabelsCount() : Clique
• updateSubjectsCount() : Clique

- v -

• ValidAround() : StructuralAnalysis_Validation

- w -

• WalshTest() : StructuralAnalysis_Validation
• WriteConformalCoordinates() : aims::ConformalMapping
• writeFloatTexture() : SulcalLinesGeodesic
• writeShortTexture() : SulcalLinesGeodesic

- ~ -

• ~Blob() : surf::Blob
• ~GreyLevelBlob() : surf::GreyLevelBlob
• ~ScaleSpaceBlob() : surf::ScaleSpaceBlob
• ~SulcalLinesGeodesic() : SulcalLinesGeodesic
• ~SulcusCorticalSnake() : aims::SulcusCorticalSnake
• ~SulcusCorticalSnake_energy() : aims::SulcusCorticalSnake_energy