#include <si/fold/inertialDomainBox.h>

Inheritance diagram for sigraph::InertialDomainBox:

[legend]

Collaboration diagram for sigraph::InertialDomainBox:

[legend]

Public Member Functions
	InertialDomainBox ()

	InertialDomainBox (const InertialDomainBox &dom)

virtual	~InertialDomainBox ()

virtual Domain *	clone () const
	Duplication.

bool	canBeFound (double x, double y, double z)
	Renvoie si le point peut se trouver aux coordonnées (x, y, z)

virtual bool	canBeFound (const Vertex v, const Graph g=0)
	Renvoie si le noeud de graphe peut appartenir au modèle concerné (donc avoir le label considéré)

virtual void	learn (const Vertex v, const Graph g=0)
	Apprends le domaine d'un morceau de sillon donné.

virtual void	learnBucket (const Vertex v, const Graph g)
	apprends 2e phase, bornes des buckets dans le repère d'inertie

virtual void	reset ()
	Réinitialise l'apprentissage (remet les stats à zéro)

virtual bool	needsMorePasses () const
	Dit s'il faut encore un passage sur une base pour que l'apprentissage soit complet.

virtual void	nextPass ()
	Effectue le changement de phase d'apprentissage.

virtual void	firstPass ()
	Revient à la première passe d'apprentissage.

virtual void	buildTree (Tree &tr) const
	Conversion en arbre (pour IO)

virtual void	cubeTalairach (std::vector< std::vector< double > > &pts) const
	Donne les coordonnées des coins dans Talairach (pas forcément les minmax internes, cf InertialDomainBox), remplit le vecteur avec les 8 points.

virtual void	diagonalize ()
	Diagonalise la matrice d'inertie.

virtual void	changeRef (double &x, double &y, double &z)
	Change de repère vers celui de la matrice d'inertie.

float	tolerenceMargin () const

void	setTolerenceMargin (float tm)

Public Member Functions inherited from sigraph::DomainBox
	DomainBox ()

	DomainBox (const DomainBox &dom)

virtual	~DomainBox ()

void	setDims (double xmin, double ymin, double zmin, double xmax, double ymax, double zmax)

double	xmin () const

double	ymin () const

double	zmin () const

double	xmax () const

double	ymax () const

double	zmax () const

const std::string &	gravityCenterAttribute () const

void	setGravityCenterAttribute (const std::string &att)

virtual void	talairach (float &v1, float &v2, float &v3, const Graph *g) const
	Transforme le vecteur {\tt (v1, v2, v3)} dans les coordonnées de Talairach (transformation dans le graphe {\tt g})

Public Member Functions inherited from sigraph::AdapDomain
virtual	~AdapDomain ()

unsigned	nData () const

void	setNData (unsigned ndata)

Public Member Functions inherited from sigraph::Domain
virtual	~Domain ()

Static Public Member Functions
static void	buildInertialDomBox (Tree parent, Tree tr)

static void	buildDomBox (Tree parent, Tree tr)

Protected Member Functions
void	learnVoxel (const std::vector< float > &rot, const std::vector< float > &scale, const std::vector< float > &transl, const std::vector< float > &vsz, const AimsVector< short, 3 > &pt)
	Apprends un voxel (2e passe)

void	learnTalVoxel (double x, double y, double z)
	Apprends un voxel (2e passe) pour un point dans Talairach.

	AdapDomain ()

	AdapDomain (const AdapDomain &dom)

Protected Member Functions inherited from sigraph::Domain
	Domain ()

	Domain (const Domain &dom)

Protected Attributes
carto::VolumeRef< float >	_inertia
	Matrice d'inertie.

Point3df	_gravity
	Centre de gravité.

carto::VolumeRef< float >	_rotation
	Matrice de rotation.

Point3df	_eigenValues
	Valeurs propres de la matrice d'inertie.

unsigned	_npoints

bool	_transfUpToDate
	Flag.

float	_tolMargin
	Marge de tolérence supplémentaire.

double	_xmin

double	_ymin

double	_zmin

double	_xmax

double	_ymax

double	_zmax

std::string	_gcattrib

unsigned	_ndata

Detailed Description

Definition at line 13 of file inertialDomainBox.h.

Constructor & Destructor Documentation

◆ InertialDomainBox() [1/2]

sigraph::InertialDomainBox::InertialDomainBox ( )

References InertialDomainBox().

Referenced by clone(), InertialDomainBox(), and InertialDomainBox().

◆ InertialDomainBox() [2/2]

sigraph::InertialDomainBox::InertialDomainBox ( const InertialDomainBox & dom )

inline

Definition at line 76 of file inertialDomainBox.h.

References _eigenValues, _gravity, _inertia, _npoints, _rotation, _tolMargin, _transfUpToDate, sigraph::DomainBox::DomainBox(), and InertialDomainBox().

◆ ~InertialDomainBox()

sigraph::InertialDomainBox::~InertialDomainBox ( )

inlinevirtual

Definition at line 91 of file inertialDomainBox.h.

Member Function Documentation

◆ buildInertialDomBox()

static void sigraph::InertialDomainBox::buildInertialDomBox	(	Tree *	parent,
		Tree *	tr )

static

◆ buildTree()

virtual void sigraph::InertialDomainBox::buildTree ( Tree & tr ) const

virtual

Conversion en arbre (pour IO)

Reimplemented from sigraph::DomainBox.

◆ canBeFound() [1/2]

virtual bool sigraph::InertialDomainBox::canBeFound	(	const Vertex *	v,
		const Graph *	g = 0 )

virtual

Renvoie si le noeud de graphe peut appartenir au modèle concerné (donc avoir le label considéré)

Parameters

v	noeud à tester. Il doit posséder l'attribut {\tt "gravity_center"} pour être utilisable
g	graphe contenant le noeud

Reimplemented from sigraph::DomainBox.

◆ canBeFound() [2/2]

bool sigraph::InertialDomainBox::canBeFound	(	double	x,
		double	y,
		double	z )

virtual

Renvoie si le point peut se trouver aux coordonnées (x, y, z)

Reimplemented from sigraph::DomainBox.

◆ changeRef()

virtual void sigraph::InertialDomainBox::changeRef	(	double &	x,
		double &	y,
		double &	z )

virtual

Change de repère vers celui de la matrice d'inertie.

◆ clone()

Domain * sigraph::InertialDomainBox::clone ( ) const

inlinevirtual

Duplication.

Reimplemented from sigraph::DomainBox.

Definition at line 85 of file inertialDomainBox.h.

References InertialDomainBox().

◆ cubeTalairach()

virtual void sigraph::InertialDomainBox::cubeTalairach ( std::vector< std::vector< double > > & pts ) const

virtual

Donne les coordonnées des coins dans Talairach (pas forcément les minmax internes, cf InertialDomainBox), remplit le vecteur avec les 8 points.

Reimplemented from sigraph::DomainBox.

◆ diagonalize()

virtual void sigraph::InertialDomainBox::diagonalize ( )

virtual

Diagonalise la matrice d'inertie.

Referenced by nextPass().

◆ firstPass()

virtual void sigraph::InertialDomainBox::firstPass ( )

virtual

Revient à la première passe d'apprentissage.

Reimplemented from sigraph::AdapDomain.

◆ learn()

virtual void sigraph::InertialDomainBox::learn	(	const Vertex *	v,
		const Graph *	g = 0 )

virtual

Apprends le domaine d'un morceau de sillon donné.

Parameters

v	sillon ou morceau de sillon sous sa forme de noeud de graphe. Le noeud doit contenir un bucket (attribut `"bucket"` ) pour pouvoir être appris
g	graphe contenant le noeud `v`; des informations globales du graphe peuvent être utilisées par le noeud

Reimplemented from sigraph::DomainBox.

◆ learnBucket()

virtual void sigraph::InertialDomainBox::learnBucket	(	const Vertex *	v,
		const Graph *	g )

virtual

apprends 2e phase, bornes des buckets dans le repère d'inertie

◆ learnTalVoxel()

void sigraph::InertialDomainBox::learnTalVoxel	(	double	x,
		double	y,
		double	z )

protected

Apprends un voxel (2e passe) pour un point dans Talairach.

◆ learnVoxel()

void sigraph::InertialDomainBox::learnVoxel	(	const std::vector< float > &	rot,
		const std::vector< float > &	scale,
		const std::vector< float > &	transl,
		const std::vector< float > &	vsz,
		const AimsVector< short, 3 > &	pt )

protected

Apprends un voxel (2e passe)

◆ needsMorePasses()

virtual bool sigraph::InertialDomainBox::needsMorePasses ( ) const

inlinevirtual

Dit s'il faut encore un passage sur une base pour que l'apprentissage soit complet.

Certains modèles peuvent apprendre en plieurs phases: par exemple, réglages de rotations / centrages, puis apprentissage des bornes dans le nouveau repère (cf InertialDomainBox dans le package fold).

Reimplemented from sigraph::AdapDomain.

Definition at line 33 of file inertialDomainBox.h.

References _transfUpToDate.

◆ nextPass()

virtual void sigraph::InertialDomainBox::nextPass ( )

inlinevirtual

Effectue le changement de phase d'apprentissage.

Reimplemented from sigraph::AdapDomain.

Definition at line 34 of file inertialDomainBox.h.

References _transfUpToDate, and diagonalize().

◆ reset()

virtual void sigraph::InertialDomainBox::reset ( )

virtual

Réinitialise l'apprentissage (remet les stats à zéro)

Reimplemented from sigraph::DomainBox.

◆ setTolerenceMargin()

void sigraph::InertialDomainBox::setTolerenceMargin ( float tm )

inline

Definition at line 46 of file inertialDomainBox.h.

References _tolMargin.

◆ tolerenceMargin()

float sigraph::InertialDomainBox::tolerenceMargin ( ) const

inline

Definition at line 45 of file inertialDomainBox.h.

References _tolMargin.

Member Data Documentation

◆ _eigenValues

Point3df sigraph::InertialDomainBox::_eigenValues

protected

Valeurs propres de la matrice d'inertie.

Definition at line 65 of file inertialDomainBox.h.

Referenced by InertialDomainBox().

◆ _gravity

Point3df sigraph::InertialDomainBox::_gravity

protected

Centre de gravité.

Definition at line 61 of file inertialDomainBox.h.

Referenced by InertialDomainBox().

◆ _inertia

carto::VolumeRef<float> sigraph::InertialDomainBox::_inertia

protected

Matrice d'inertie.

Definition at line 59 of file inertialDomainBox.h.

Referenced by InertialDomainBox().

◆ _npoints

unsigned sigraph::InertialDomainBox::_npoints

protected

Definition at line 66 of file inertialDomainBox.h.

Referenced by InertialDomainBox().

◆ _rotation

carto::VolumeRef<float> sigraph::InertialDomainBox::_rotation

protected

Matrice de rotation.

Definition at line 63 of file inertialDomainBox.h.

Referenced by InertialDomainBox().

◆ _tolMargin

float sigraph::InertialDomainBox::_tolMargin

protected

Marge de tolérence supplémentaire.

Definition at line 70 of file inertialDomainBox.h.

Referenced by InertialDomainBox(), setTolerenceMargin(), and tolerenceMargin().

◆ _transfUpToDate

bool sigraph::InertialDomainBox::_transfUpToDate

protected

Flag.

Definition at line 68 of file inertialDomainBox.h.

Referenced by InertialDomainBox(), needsMorePasses(), and nextPass().

The documentation for this class was generated from the following file:

si/fold/inertialDomainBox.h

SiGraph: sulcal graphs

Public Member Functions

Static Public Member Functions

Protected Member Functions

Protected Attributes

Detailed Description

Constructor & Destructor Documentation

◆ InertialDomainBox() [1/2]

◆ InertialDomainBox() [2/2]

◆ ~InertialDomainBox()

Member Function Documentation

◆ buildInertialDomBox()

◆ buildTree()

◆ canBeFound() [1/2]

◆ canBeFound() [2/2]

◆ changeRef()

◆ clone()

◆ cubeTalairach()

◆ diagonalize()

◆ firstPass()

◆ learn()

◆ learnBucket()

◆ learnTalVoxel()

◆ learnVoxel()

◆ needsMorePasses()

◆ nextPass()

◆ reset()

◆ setTolerenceMargin()

◆ tolerenceMargin()

Member Data Documentation

◆ _eigenValues

◆ _gravity

◆ _inertia

◆ _npoints

◆ _rotation

◆ _tolMargin

◆ _transfUpToDate