SiGraph: sulcal graphs


sigraph Namespace Reference

Classes

class  AdapDescr
 Clique descriptor with description for learning. More...
 
class  AdapDomain
 Domaine de validité adaptatif. More...
 
class  AdapFinder
 Sélecteur de modèles adaptatifs (Adaptive). More...
 
class  Adaptive
 Elément adaptatif (classe abstraite). More...
 
class  AdaptiveLeaf
 El�ment adaptatif terminal. More...
 
class  AdaptiveTree
 Elément adaptatif multiple. More...
 
class  Anneal
 Recuit simulé. More...
 
class  AnnealConfigurator
 Lecture de fichiers de params de recuit (syntaxe siRelax.stx). More...
 
class  AnnealConnectExtension
 
class  AnnealConnectVoidExtension
 
class  AnnealExtension
 Extensions au recuit simulé. More...
 
class  ArnaudDataDrivenModel
 
class  ArnaudFinder
 
class  ArnaudFinderParser
 
class  ArnaudIntraPSModel
 
class  ArnaudLowerScaleModel
 
class  ArnaudSimilarityModel
 
class  BadLearner
 Inverse la sortie d'apprentissage. More...
 
class  BrainJuncDescr
 
class  CGraph
 Graphes avec étiquettes et gestion de cliques (classe abstraite). More...
 
class  Clique
 Classe Clique. More...
 
class  CliqueCache
 Classe fourre-tout qui stocke des résultats plus ou moins intermédiaires de calculs sur les cliques. More...
 
class  CliqueDescr
 Descripteur de clique (classe abstraite). More...
 
class  CliqueMemorizer
 Memorizes clique labels and restores them afterwards. More...
 
class  ConstLearner
 Séquence d'apprentissage de cliques constantes. More...
 
class  ConstModel
 Modèle très simple: donne un potentiel constant... More...
 
class  CopyLearner
 Duplicateur de clique. More...
 
class  CorticalEdge
 
class  DBLearnable
 
class  DBVectorLearnable
 
class  DescrParser
 
class  DimReductor
 Feature Selector : More...
 
class  DimReductorParser
 
class  Domain
 Domaine de validité. More...
 
class  DomainBox
 Domaine de validité par boîte englobante. More...
 
class  DomainBox2
 
class  DomainRBF
 
class  DomReader
 Lecteur de domaine de validité (Domain Reader) More...
 
class  DomWriter
 Classe DomWriter : écriture de domaines de validité de noeud. More...
 
class  EmptyAvoidLearner
 Change la sortie d'apprentissage à 0 pour les cliques qui n'ont pas de noeud significatif non-void. More...
 
struct  EnergyField
 Type utilisé pour les calculs d'énergie : Classe de stockage des champs d'énergie pour l'échantillonneur de Gibbs ou l'ICM. More...
 
class  ExoticGraphReader
 Classe ExoticGraphReader : classe de base de lecture de graphes "exotiques". More...
 
class  ExoticTreeReader
 Classe ExoticTreeReader : classe de base de lecture d'arbres "exotiques". More...
 
class  ExoticTreeWriter
 Classe ExoticTreeWriter : écriture d'arbres "exotiques". More...
 
class  FakeDimReductor
 
class  FDParser
 
class  FFParser
 
class  FGraph
 Folds graph. More...
 
class  FinderParser
 
class  FoldCache
 Cache de clique de sillon. More...
 
class  FoldCopier
 Duplicateur de clique de sillons, qui prend en compte cet andouille de noeud "brain_hull" qui fout le bazar. More...
 
class  FoldDescr
 Descripteur de sillon. More...
 
class  FoldDescr2
 Descripteur de sillon version 2. More...
 
class  FoldDescr3
 Cortical Fold Descriptor, version 3. More...
 
class  FoldDescr4
 Fold descriptor, version 4 (11/2005). More...
 
class  FoldDescr5
 Fold descriptor, version 5 (07/2006). More...
 
class  FoldFakeRel
 Evalue les instances de relations qui n'existent pas dans le modèle. More...
 
class  FoldFarLabelsChanger
 Change des labels dans les cliques de sillons, prend des exemples loin des bons. More...
 
class  FoldFinder
 Sélecteur de sillon/edge modèle. More...
 
class  FoldLabels
 Classe labels de sillons. More...
 
class  FoldLabelsChanger
 Change des labels dans les cliques de sillons. More...
 
class  FoldLabelsTranslator
 Table de correspondance entre labels réels (des graphes de sillons) et labels modèles (des graphes modèles). More...
 
class  FoldLearnFactory
 
class  FoldLearnReader
 
class  FoldNoiser
 Bruiteur de sillon. More...
 
class  FoldReader
 Folds graph reader. More...
 
class  FoldReducedLabelsChanger
 Change des labels dans les cliques de sillons, parmi les noeuds voisins des noeuds significatifs. More...
 
class  FoldVertex
 
class  FoldWriter
 Classe FoldWriter : écriture de graphes de sillons. More...
 
class  FRGraph
 Folds Random graph. More...
 
class  FrgReader
 Classe FrgReader : lecteur de graphes aléatoires de sillons. More...
 
class  FrgWriter
 FrgWriter : writing random filds graphs. More...
 
class  FunctionalSketchDataDrivenModel
 
class  FunctionalSketchFinder
 
class  FunctionalSketchFinderParser
 
class  FunctionalSketchIntraPSModel
 
class  FunctionalSketchLowerScaleModel
 
class  FunctionalSketchSimilarityModel
 
class  GaussVectorLearnable
 
class  GeneratedVector
 
class  GFParser
 
class  GridOptimizer
 Grid Optimizer. More...
 
class  GridOptimizerParameter
 
class  GyrusDescr
 
class  GyrusFinder
 Gyrus model selector. More...
 
class  HullJunctionEdge
 
class  IncrementalSubAdaptive
 
class  InertialDomainBox
 
class  InterFoldCache
 Cache de clique de relation sillon-sillon. More...
 
class  InterFoldDescr
 
class  InterFoldDescr2
 
class  InterFoldDescr4
 
class  InterFoldDescr5
 
class  JunctionEdge
 
class  LabelsChanger
 Change des labels dans les cliques. More...
 
class  Learnable
 
struct  LearnConstParam
 
class  Learner
 Séquence d'apprentissage, classe de base (abstraite). More...
 
class  LearnFactory
 Learner creator. More...
 
struct  LearnParam
 
class  LearnReader
 
class  LearnStopCriterion
 Critère d'arrêt pour les apprentissages. More...
 
class  LowLevelFoldArgReader
 
class  LowLevelFRGArgReader
 
class  LowLevelFRGArgWriter
 
class  MatrixDimReductor
 Matrix Dimension Reductor (for instance svd) More...
 
class  MeanMixer
 Mixeur moyen. More...
 
class  MGraph
 Graph modèle (classe abstraite). More...
 
class  MGWriter
 
class  Mixer
 Mixeur d'experts. More...
 
class  MixerParser
 
class  Model
 Modèle pour l'évaluation de cliques de graphes (classe abstraite). More...
 
class  ModelFinder
 Chercheur de modèle (classe abstraite). More...
 
class  MReader
 
class  MWriter
 Classe MWriter : écriture d'arbres d'éléments modèles. More...
 
class  Noiser
 Bruiteur de clique. More...
 
class  NonIncrementalSubAdaptive
 
class  NullDomain
 Classe "nulle part" ... More...
 
class  NullModel
 Elément non-adaptatif, qui ne fait RIEN. More...
 
class  OneLabelTrier
 Change des labels dans les cliques de sillons. More...
 
class  Optimizer
 Optimizer. More...
 
class  OptimizerParser
 
struct  OverlapMap
 
class  PliDePassageEdge
 
class  RandComp
 "Functor" de comparaison aléatoire. More...
 
class  RanksDimReductor
 Ranks Feature Selector. More...
 
class  RoiDescr
 
class  RoiFinder
 ROI model selector. More...
 
class  RoiFParser
 
class  SAParser
 
class  SelectiveLearner
 Apprend seuelement les modèles vérifiant un certain critère. More...
 
class  SelectiveTrainer
 Trainer sélectif: n'apprend que certains modèles. More...
 
class  SGIterator
 Itérateur de sous-graphe. More...
 
class  SGProvider
 Fabrique de sous-graphes. More...
 
class  Si
 classe fourre-tout, juste pour grouper des variables et des fonctions globales More...
 
class  SiDBLearnable
 
class  SiInfo
 
class  SiSvmPlugin
 
class  SiVectorLearnable
 Specialization for sigraph : Y as only one dim. More...
 
class  StatLearner
 Apprend les stats des réseaux, pas les réseaux eux-mêmes. More...
 
class  SubAdaptive
 Sous-élément adaptatif (classe abstraite). More...
 
class  SubAdGauss
 Enrobage d'un réseau de Gaussiennes. More...
 
class  SubAdLogGauss
 Enrobage d'un réseau de Gaussiennes. More...
 
class  SubAdMixGauss
 Mixture of Gaussians. More...
 
class  SubAdMlp
 Classe élémentaire contenant un perceptron multicouches. More...
 
class  SubAdResponse
 
class  SubAdSvm
 
class  SulcalSketchDataDrivenModel
 
class  SulcalSketchFinder
 
class  SulcalSketchFinderParser
 
class  SulcalSketchSimilarityModel
 
class  SurfaceBasedFunctionalSketchDataDrivenModel
 
class  SurfaceBasedFunctionalSketchFinder
 
class  SurfaceBasedFunctionalSketchFinderParser
 
class  SurfaceBasedFunctionalSketchIntraPSModel
 
class  SurfaceBasedFunctionalSketchLowerScaleModel
 
class  SurfaceBasedFunctionalSketchSimilarityModel
 
struct  SurfaceBasedOverlapMap
 
class  SvmSAParser
 
class  TerminalLearner
 Terminal element for learning sequence tree. More...
 
class  TopAdaptive
 
class  TopModel
 
class  Trainer
 Apprentissage des éléments adaptatifs des graphes modèles. More...
 
class  TrainerIterator
 
class  TreePostParser
 Scans a tree and do something to each element. More...
 
class  VectorLearnable
 
class  VertexClique
 VertexClique - clique of graph vertices. More...
 
class  VertexCliqueProvider
 Fabrique de cliques de noeuds, itérées dans un ordre aléatoire. More...
 
class  VertexProvider
 Fabrique de vertex simples, itérés dans un ordre aléatoire. More...
 

Typedefs

typedef std::set< Vertex * > CComponent
 Composante connexe.
 
typedef struct sigraph::LearnConstParam LearnConstParam
 
typedef struct sigraph::LearnParam LearnParam
 

Functions

DomWriteroperator<< (DomWriter &dw, const Domain &dom)
 
Sisi ()
 Accès au singleton Si.
 
void concatenateGraphs (const std::vector< Graph * > in, Graph &out, const std::string &subjectatt)
 
void recoverIndividualGraph (const std::vector< Graph * > subjects, Graph &multi, const std::string &vertexatt)
 
ExoticTreeWriteroperator<< (ExoticTreeWriter &tw, const Tree &tr)
 
ExoticTreeReaderoperator>> (ExoticTreeReader &er, Tree &t)
 
MWriteroperator<< (MWriter &mw, const Model &m)
 

Typedef Documentation

◆ CComponent

typedef std::set<Vertex *> sigraph::CComponent

Composante connexe.

Definition at line 14 of file vertexclique.h.

◆ LearnConstParam

typedef struct sigraph::LearnConstParam sigraph::LearnConstParam

◆ LearnParam

typedef struct sigraph::LearnParam sigraph::LearnParam

Function Documentation

◆ concatenateGraphs()

void sigraph::concatenateGraphs ( const std::vector< Graph * > in,
Graph & out,
const std::string & subjectatt )

◆ operator<<() [1/3]

DomWriter & sigraph::operator<< ( DomWriter & dw,
const Domain & dom )
inline

Definition at line 30 of file domWriter.h.

References sigraph::DomWriter::write().

◆ operator<<() [2/3]

ExoticTreeWriter & sigraph::operator<< ( ExoticTreeWriter & tw,
const Tree & tr )
inline

Definition at line 42 of file exoticTreeWriter.h.

References Tree::const_accept().

◆ operator<<() [3/3]

MWriter & sigraph::operator<< ( MWriter & mw,
const Model & m )
inline

Definition at line 38 of file mWriter.h.

References sigraph::MWriter::write().

◆ operator>>()

ExoticTreeReader & sigraph::operator>> ( ExoticTreeReader & er,
Tree & t )
inline

Definition at line 68 of file exoticTreeReader.h.

References Tree::accept().

◆ recoverIndividualGraph()

void sigraph::recoverIndividualGraph ( const std::vector< Graph * > subjects,
Graph & multi,
const std::string & vertexatt )

◆ si()

Si & sigraph::si ( )

Accès au singleton Si.